1. Η μοριακή ανάλυση σε επίπεδο mRNA ενδείκνυται ΣΕ ΠΕΡΙΠΤΩΣΕΙΣ ΠΟΥ ΕΧΕΙ ΗΔΗ ΔΙΑΓΝΩΣΘΕΙ ΚΥΤΤΑΡΟΛΟΓΙΚΑ ΥΨΗΛΟΥ ΒΑΘΜΟΥ ΕΝΔΟΠΙΘΗΛΙΑΚΗ ΒΛΑΒΗ (HIGH GRADE SIL) με υψηλή πιθανότητα καρκινικής εξαλλαγής, 

2. Σε περίπτωση μόλυνσης με τα στελέχη 16,18,31,33 και 45 , η ορθολογική διαχείριση της HPV λοίμωξης θα μπορούσε ΕΠΙΣΗΣ να περιλαμβάνει μοριακή ανάλυση σε επίπεδο mRNA .

Με τον τρόπο αυτό ελέγχεται ο βαθμός μεταγραφής των γονιδίων Ε6/Ε7,ο οποίος αντανακλά την ογκογόνο δυναμική του ιού και συνάδει με την μετατροπή του επιθηλίου σε διαφορετικούς βαθμούς δυσπλασίας πριν αυτή εκδηλωθεί με κυτταρομορφολογικές αλλοιώσεις.